截至2024年5月，学校建有玄武门、江宁2个校区，占地2100余亩。建筑面积70.2万平方米。设有16个院部、31个本科专业（类）、3个一级学科博士学位授权点、1个博士专业学位授权点、8个一级学科硕士学位授权点、5个硕士专业学位授权点、2个博士后流动站。学校10个学科领域的ESI排名进入全球前1%，其中药理学与毒理学排名全球前1‰（万分之1.266），位列全球第16位、亚洲高校第1位。在2023 US News 世界大学排行榜中，药理学与毒理学学科位列全球第7位。在世界大学排名中心（CWUR）学科排行中，学校药物化学学科位列全球第3位。在2023软科中国最好学科排名中， 执业药师考试合格条件学校药学、中药学学科分别排名国内第1位、第2位， 国家执业中药师报考条件均进入“中国顶尖学科”，宁夏执业药师报名条件专任教师1102人[5]。

学校始建于1936年，前身为国立药学专科学校。1937年迁往汉口，1938年迁往重庆，1946年回迁南京。1950年更名为华东药学专科学校。1952年，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入学校，成立华东药学院。1956年更名为南京药学院。1986年与筹建中的南京中药学院合并，成立中国药科大学。2000年，学校由国家药品监督管理局整体划转教育部管理。2001年，江苏省药科学校整体并入学校[2]。

中国药科大学位列2023年ABC中国大学排名医药类第8名[6]。